Chuyến bay 9525 cất cánh từ đường băng 07R tại Sân bay Barcelona–El Prat vào 10:01 CET (09:01 UTC) và được lên lịch hạ cánh tại sân bay Düsseldorf vào lúc 11:39 CET (10:39 UTC).[3][11] Giờ khởi hành lúc đầu được sắp xếp vào 9:35 CET (08:35 UTC).[12]Chính quyền hàng không pháp (bộ hàng không dân sự Pháp) (DGAC) tuyên bố rằng các phi công đã không gửi tín hiệu cấp cứu, mà đài kiểm soát tại Aix-en-Provence, lúc 10:47 CET đã báo động hiểm nguy sau khi máy bay hạ độ cao mà không xin phép.[13][14] Chiếc máy bay đã đạt độ cao hành trình, tầng bay 380 (xấp xỉ 38.000 ft [12.000 m]) vào lúc 10:45. Chỉ một phút sau, chiếc máy bay bắt đầu giảm độ cao - mục đích của giảm độ cao vẫn chưa rõ. 8 phút sau, sau khi giảm độ cao đột ngột, trạm kiểm soát không lưu đã mất liên lạc với máy bay. Chiếc máy bay đã đâm vào vùng hẻo lánh ở độ cao 1500 m dưới ngọn núi Estrop nằm trong thung lũng Blanche ở Prads-Haute-Bléone, cách 100 kilômét (62 dặm) về phía tây bắc Nice.[15][16][17] Nó biến mất khỏi màn hình radar vào 10:53 CET. Vào thời điểm đó thì máy bay đang bay tại độ cao 6.800 ft (2.100 m).[1]Đây là thảm họa hàng không chết người nhiều nhất tại Pháp kể từ chuyến bay 1308 của Inex-Adria Aviopromet vào năm 1981, đã làm 180 người thiệt mạng[18]. Đây cũng là tai nạn dân sự đầu tiên của ngành hàng không dân sự Pháp kể từ chiếc Concorde trong chuyến bay 4590 của Air France rơi gần Paris vào năm 2000.[19]